在2013-14赛季的欧冠比赛中，巴萨输给了马竞。在首回合1/4决赛中，巴萨客场挑战马竞，最终以1-1战平。
回到主场的第二回合，巴萨虽然在比赛中占据绝对优势，但却被马竞反击打入一球，最终0-1输给了对手，无缘晋级四强。这场比赛也成为了巴萨队长普约尔的告别战，让这位传奇球员的离开更加遗憾。
尤普·海因克斯，这是海帅第三次执教拜仁。
2013年5月25日，拜仁在四年内第三次进入欧洲冠军联赛决赛，并在温布利球场以2:1战胜同国对手多特蒙德，第5次赢得欧洲冠军奖杯。
分别由曼朱基奇，京多安和罗本进球。欧冠决赛在英国温布利大球场进行，拜仁慕尼黑对阵多特蒙德。上半场双方门将都有神奇表现，罗本失单刀；下半场曼朱基奇打破僵局，罗伊斯造点，京多安主罚扳平比分，罗本终场前完成绝杀。最终，拜仁2-1多特捧杯。
曼朱基齐进一个，京多安罚点球进一个，罗本绝杀进一个。
第89分钟，里贝里脚后跟妙传，罗本从中路高速杀进禁区，接球后的他面对本场比赛表现神勇的多特蒙德门将魏登费勒巧射破门。进球后的罗本与其说是在庆祝，更不如说是在发泄。这位荷兰球星宣泄着自己整整3年来的郁闷和沮丧。
a组:1曼联2勒沃库森3顿涅茨克矿工4皇家社会B组:1皇家马德里2加拉塔萨雷3哥本哈根4尤文图斯C组1巴黎圣日尔曼2奥林匹亚科斯3本菲卡4安德莱赫特D组1拜仁慕尼黑2曼城3莫斯科中央4比尔森e组:1切尔西2沙尔克043巴塞尔4布加勒斯特星f组……
